El gobierno del Movimiento YMCA en América Latina y el Caribe se construye a partir de las cinco subregiones (Andina, Brasil, Caribe, Cono Sur, Mesoamérica) que reconocen raíces históricas, culturales y sistemas de comercio e integración subregional.

Cada una de estas subregiones tiene vocería en el Comité Ejecutivo regional y a la vez una persona Coordinadora Ejecutiva por cada subregión que integra junto al Secretariado Ejecutivo, la estructura de gobierno y gestión.